Co-expression of P53 and P60-katanin shapes transcriptome dynamics.

Microtubules (MT), essential elements of the cytoskeleton have important roles in the cell such as intracellular cargo transport, cell motility and cell division. They provide support, growth and maintenance of the axonal and dendritic processes in neurons. Microtubule severing proteins such as katanin and spastin have roles in microtubule reconfiguration. Katanin is one of the best characterized severing proteins and is composed of catalytic subunit p60- katanin and regulatory subunit p80-katanin. The microtubule severing mechanism of p60- katanin has been depicted in detail, but how p60-katanin itself is regulated is still little-known. p53 is an important protein between proliferation and differentiation. It regulates different cellular mechanisms such as cell cycle arrest, senescence, differentiation, and apoptosis. p53 controls proliferation in dividing cells and is related to differentiation by means of affecting neuronal process length in non-dividing neurons. Both p53 and p60-katanin have critical roles in proliferation and differentiation separately. Moreover, these proteins were shown to physically interact, but their combined effect remains unclear. To this aim, the current study reveals the effects of p53 – p60-katanin co-expression on transcriptome of the fibroblast cells. Data indicated that the transcriptome of many different pathways such as actin regulation, neuroactive ligand-receptor interaction, and serotonergic synapses pathways were altered under p53 – p60-katanin co-expression conditions. Exploring combined effect of p53 and p60-katanin will help in design of new studies to better understand not only microtubule regulation but also neurodegenerative diseases that are linked to the reactivation of cell cycle and neuronal damage where two of these players take place. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Mikrotübüller (MT), hücre iskeletinin temel elemanları olup hücre içi kargo taşınması, hücre hareketliliği ve hücre bölünmesi gibi hücrede önemli rollere sahiptir. Ayrıca sinir hücreleri olan nöronlarda, aksonal ve dendritik yapıların desteklenmesi ve uzaması için önemli görevlere sahiptirler. Katanin ve spastin gibi mikrotübül kesici proteinler, mikrotübüllerin yeniden yapılandırılmasında rol oynar. Katanin, en iyi karakterize edilmiş MT kesici proteinlerden olup, katalitik alt birim p60-katanin ve düzenleyici alt birim p80-katanin'den oluşur. p60-katanin'in mikrotübül kesme mekanizması oldukça iyi bilinmektedir, ancak p60- katanin'in kendisinin nasıl düzenlendiği halen az bilinen bir konudur. p53, proliferasyon ve farklılaşma arasında kritik bir proteindir. Hücre döngüsünü, yaşlanma, farklılaşma ve apoptoz gibi farklı hücresel mekanizmaları düzenler. p53'ün bölünen hücrelerde proliferasyonu kontrol ettiği, bölünmeyen nöronlarda ise farklılaşma ile ilişkili olduğu ortaya konmuştur. Hem p60- katanin hem de p53, ayrı ayrı proliferasyon ve farklılaşmada kritik rollere sahiptir. Ayrıca, bu proteinlerin fiziksel olarak etkileşimde bulunduğu da gösterilmiştir, ancak bu proteinlerin birleşik etkisi belirsizliğini korumaktadır. Bu amaçla, mevcut çalışma, p53 ve p60-katanin’in birlikte eksprese edilmesinin fibroblast hücrelerinin transkriptomu üzerindeki etkilerini ortaya koymaktadır. Veriler, aktin düzenlenmesi, nöroaktif ligand-reseptör etkileşimi, serotonerjik sinaps yolları gibi birçok farklı yolakların transkriptomlarının p53 – p60-katanin’in birlikte ekprese edildiğinde değiştiğini göstermiştir. p53 ve p60-katanin'in birleşik etkisinin araştırılması, sadece mikrotübül düzenlemesini daha iyi anlamak için değil, aynı zamanda bu iki proteinin rol oynadığı hücre bölünmesinin yeniden aktifleşmesi ve nöronal hasarla ilişkili nörodejeneratif hastalıkları daha iyi anlamak için yeni çalışmaların tasarlanmasına da öncülük edecektir. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Copyright of Trakya University Journal of Natural Sciences is the property of Trakya University Journal of Natural Sciences (TUJNS) and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use. This abstract may be abridged. No warranty is given about the accuracy of the copy. Users should refer to the original published version of the material for the full abstract. (Copyright applies to all Abstracts.)