FLOW-CASA: MOTILITÁSI PARAMÉTEREK GYORS, AUTOMATIZÁLT KLASZTERANALÍZISE FLOW CITOMETRIÁS ADATELEMZŐ SZOFTVER ALKALMAZÁSÁVAL. (Hungarian)

FLOW-CASA: FAST, AUTOMATED CLUSTER ANALYSIS OF MOTILITY PARAMETERS USING A FLOW CYTOMETRIC DATA ANALYSIS SOFTWARE. (English)

Computer-Assisted Sperm Analysis (CASA), is a widely used tool for controlling sperm quality in farm animals, and has been commercially available for several decades. CASA systems can be considered as special cytometers that record motion rate values rather than light intensity, but commercial CASA softwares are not capable of performing analysis at cellular level, typically reporting only the proportion of individual sperm subpopulations in a given sample, resulting in significant loss of information. In the preliminary experiment, motility of cryopreserved-thawed bull sperm and fallow deer sperm collected from the epididymis were evaluated using a commercial CASA system without the use of species-specific settings. Raw data files were tabulated with Excel software, then saved in txt format and analyzed with a flow cytometer data analysis software. The velocity values recorded by CASA can be evaluated at the cellular level, similar to the light intensity values recorded with a flow cytometer. The cytometer software also allows the visualization of histograms and two-dimensional dot-plot diagrams for velocity parameters, as well as the use of data analysis tools such as lin-log transformation, selection of markers and regions, gating, histogram overlay of different samples, etc. Cell-level analysis allows more reliable recognition of individual sperm subpopulations and more sensitive detection of sperm physiological changes. As species-specific instrument settings are not required, CASA measurements can be extended to previously untested species. This multi-stage data management and evaluation approach can be a useful tool in the basic spermatological research and reproductive toxicology studies. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

A gazdasági állatok spermaminőség-ellenőrzésének széles körben alkalmazott eszköze a számítógépes motilitásvizsgálat (Computer-Assisted Sperm Analysis, CASA), a műszerek több évtizede elérhetők kereskedelmi forgalomban. A CASA rendszerek olyan speciális citométernek tekinthetők, amelyekkel nem fényintenzitási, hanem mozgási sebességértékeket rögzítenek, a kereskedelmi szoftverek azonban nem képesek a sejtszintű analízis végrehajtására, jellemzően csak az adott minta egyes spermium alpopulációinak arányát adják meg eredményként, ami jelentős információvesztést jelent. A szerzők előkísérletükben mélyhűtött-felolvasztott bikaspermiumok, illetve mellékheréből gyűjtött dámvad spermiumok motilitását értékelték egy kereskedelmi forgalomban elérhető CASA rendszerrel, fajspecifikus beállítások alkalmazása nélkül. A nyers adatfájlokat Excel szoftverrel rendezték táblázatba, majd txt formátumban mentve exportálták és elemezték egy flow (áramlási) citométeres adatelemző szoftverrel. A CASA által rögzített sebességértékek sejtszinten értékelhetőek, hasonlóan az áramlási citométerrel rögzített fényintenzitási értékekhez. A citométeres szoftver lehetővé teszi a sebességi paraméterek esetén is hisztogramok és kétdimenziós dot-plot ábrák vizualizációját, illetve az olyan adatelemzési eszközök alkalmazását is, mint a lin-log transzformáció, markerek és régiók kijelölése, kapuzás, különböző minták egymásra rétegezése, stb. A sejtszintű elemzés az egyes spermium alpopulációk biztosabb felismerését és a sejtélettani változások érzékenyebb észlelését teszi lehetővé. Mivel fajspecifikus műszerbeállításokra nincs szükség, a CASA-elemzések eddig nem vizsgált állatfajokra is kiterjeszthetők. A többlépcsős adatkezelés és –értékelés felhasználási lehetőségei a spermatológiai alapkutatások, reproduktív toxikológiai vizsgálatok területén kereshetők. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Copyright of Animal Breeding & Feeding / Állattenyésztés és Takarmányozás is the property of Herman Otto Intezet Nonprofit Kft. and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use. This abstract may be abridged. No warranty is given about the accuracy of the copy. Users should refer to the original published version of the material for the full abstract. (Copyright applies to all Abstracts.)