Genetic diversity of the Bambara groundnut (Vigna subterranea (L.) Verdc.) as assessed by SSR markers.

Bambara groundnut (Vigna subterranea (L.) Verdc.) is an important African legume crop. In this study, a collection consisting of 240 accessions was analyzed using 22 simple sequence repeat (SSR) markers. In total, 166 alleles were detected, with a mean of 7.59 alleles per locus. Allelic and gene diversities were higher in the west African and Cameroon/Nigeria regions with 6.68 and 6.18 alleles per locus, and 0.601 and 0.571, respectively. The genetic distance showed high similarity between west African and Cameroon/Nigeria accessions. Principal coordinate analyses and neighbor-joining analysis consistently revealed that the majority of west African accessions were grouped with Cameroon/Nigeria accessions, but they were differentiated from east African, central African, and southeast Asian accessions. Population structure analysis showed that two subpopulations existed, and most of the east African accessions were restricted to one subpopulation with some Cameroon/Nigeria accessions, whereas most of the west African accessions were associated with most of the Cameroon/Nigeria accessions in the other subpopulation. Comparison with SSR analysis of other Vigna cultigens, i.e., cultivated azuki bean (Vigna angularis) and mungbean (Vigna radiata), reveals that the mean gene diversity of Bambara groundnut was lower than azuki bean but higher than mungbean. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Le pois bambara (Vigna subterranea (L.) Verdc.) est une légumineuse importante en Afrique. Dans ce travail, les auteurs ont étudié une collection de 240 accessions à l'aide de 22 marqueurs SSR. Au total, 166 allèles ont été détectés pour une moyenne de 7,59 allèles par locus. La diversité allélique et la diversité génique étaient supérieures en Afrique de l'Ouest ainsi qu'au sein de la région englobant le Cameroun/Nigéria avec 6,68 et 6,18 allèles par locus et des indices de 0,601 et 0,571 respectivement. L'analyse de la diversité génétique a montré une grande similarité entre les accessions de l'Afrique de l'Ouest et celles du Cameroun/Nigéria. Des analyses en coordonnées principales et « neighbor-joining » ont indiqué de manière constante que la majorité des accessions d'Afrique de l'Ouest formaient un groupe avec celles du Cameroun/Nigéria, alors qu'elles contrastaient fortement avec celles de l'Afrique de l'Est et du Centre ainsi que de l'Asie du Sud-Est. Une analyse de la structure de la population a montré l'existence de deux sous-populations où la majorité des accessions d'Afrique de l'Est formaient une sous-population avec quelques accessions du Cameroun/Nigéria tandis que la majorité des accessions d'Afrique de l'Ouest formaient, avec la plupart des accessions du Cameroun/Nigéria, une autre sous-population. Une comparaison avec les données SSR obtenues chez d'autres espèces cultivées du genre Vigna, le haricot azuki (Vigna angularis) et le haricot mungo (Vigna radiata) a révélé que la diversité génique moyenne chez le pois bambara était plus faible que chez le haricot azuki mais plus élevée que chez le haricot mungo. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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